No Japão a taxa de aparecimento de kaiju está entre as mais altas do mundo, tanto que enormes criaturas trazendo destruição o invadem quase diariamente. Kafka Hibino, que hoje trabalha para uma empresa especializada no descarte de carcaças de kaiju, já aspirou se tornar membro das Forças de Defesa, as unidades especiais encarregadas de suprimir monstros e defender o país. Um dia, porém, um organismo misterioso entra no corpo de Kafka, transformando-o no que as Forças de Defesa batizarão com o codinome "Kaiju No.8"... Começa a saga do homem que se tornou kaiju!